Institut Bergonié
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GROUPE ONCOGÉnÉtique

MICHEL LONGY

Introduction

Les activités de recherche du groupe « Génétique » visent à mieux caractériser les syndromes de prédisposition héréditaire au cancer actuellement identifiés en termes de risque tumoral, de pénétrance et d’expressivité. L’étude des corrélations génotype-phénotype et l’évaluation des prises en charges proposées qu’il s’agissent de dépistage, de prévention, de traitements curatifs spécifiques ou de prise en charge psychologique sont également abordées. Cette activité se traduit par une participation active à plusieurs études nationales comme GENEPSO, GEMO, LIFSCREEN ou COVAR par exemple. De manière plus spécifique, le groupe poursuit son investissement dans l’étude des altérations tant germinales que somatiques du gène PTEN en pathologie héréditaire et dans le cancer du sein.

L’exploration des sites de régulation de l’expression de ce gène fait en particulier l’objet de plusieurs projets. Le groupe est par ailleurs impliqué dans l’identification de nouveaux gènes de prédisposition au cancer du sein à travers des stratégies associant génotypage tumoral et séquençage de nouvelle génération et dans l’exploration des situations de mosaïcisme impliquées dans la prédisposition au cancer.

Activités - Etudes propres à l'équipe
 
Apport du séquençage de nouvelle génération dans le diagnostic moléculaire de la maladie de Cowden
Stéphanie Gourdon (M2 génétique), Mayliss Dupouy (M2 bioinformatique), Nicolas Sévenet, Michel Longy. Etude de patients au phénotype de maladie de Cowden sans mutation du gène PTEN identifié.


Valeur prédictive des altérations de PTEN dans le cancer du sein vis-à-vis de la prédisposition BRCA1
Natalie Jones, Audrey Rouault, Nicolas Sévenet. Etude des relations entre les anomalies constitutionnelles et somatique du gène BRCA1, les altérations somatiques du gène PTEN et les cancers du sein de type « triple négatif ».

Recherche de révertants PTEN dans la résistance aux inhibiteurs de PARP
Natalie Jones, Nicolas Sévenet. Analyse génétique de lignées cellulaires tumorales mutées PTEN après leur montée en résistance vis-à-vis d’un inhibiteur de PARP.

Identifications de nouveaux gènes de prédisposition au cancer du sein par génotypage tumoral et séquençage de nouvelle génération.
Virginie Bubien (thèse sciences de la vie), Eric Letouzé (CIT Ligue contre le Cancer, Paris), Michel Longy. Etude de la valeur localisatrice du génotypage tumoral de plusieurs cas de cancers du sein dans une même famille vis-à-vis de gènes de prédisposition.

Contribution des mosaïques colo-rectales des gènes MMR dans les cancers colo-rectaux de type MSI.
Françoise Bonnet, Emmanuelle Barouk-Simonet, Isabelle Soubeyran. L’existence d’assez nombreux cas de cancers colo-rectaux de type MSI high sans mutation identifiable des gènes MMR conduit à explorer des situations de mosaïque somatique et d’hyper méthylation des promoteurs de ces gènes afin d’interpréter ces discordances.

Publications originales, revues, conférences

ARTICLES ORIGINAUX

Busa T, Milh M, Degardin N, Girard N, Sigaudy S, Longy M, Olshchwang S, Sobol H, Chabrol B, Philip N. Clinical presentation of PTEN mutations in childhood in the absence of family history of Cowden syndrome. Eur J Paediatr Neurol 2014 ; Dec 16. doi: 10.1016/j.ejpn.2014.11.012. [Epub ahead of print] (IF : 1.934, SIGAPS : C).

Kuchenbaecker KB, Neuhausen SL, Robson M, Barrowdale D, McGuffog L, Mulligan AM, Andrulis IL, Spurdle AB, Schmidt MK, Schmutzler RK, Engel C, Wappenschmidt B, Nevanlinna H, Thomassen M, Southey M, Radice P, Ramus SJ, Domchek SM, Nathanson KL, Lee A, Healey S, Nussbaum RL, Rebbeck TR, Arun BK, James P, Karlan BY, Lester J, Cass I, Terry MB, Daly MB, Goldgar DE, Buys SS, Janavicius R, Tihomirova L, Tung N, Dorfling CM, van Rensburg EJ, Steele L, Hansen O, Ejlertsen B, Gerdes AM, Nielsen FC, Dennis J, Cunningham J, Hart S, Slager S, Osorio A, Benitez J, Duran M, Weitzel JN, Tafur I, Hander M, Peterlongo P, Manoukian S, Peissel B, Roversi G, Scuvera G, Bonanni B, Mariani P, Volorio S, Dolcetti R, Varesco L, Papi L, Tibiletti MG, Giannini G, Fostira F, Konstantopoulou I, Garber J, Hamann U, Donaldson A, Brewer C, Foo C, Evans DG, Frost D, Eccles D, Douglas F, Brady A, Cook J, Tischkowitz M, Adlard J, Barwell J, Ong KR, Walker L, Izatt L, Side LE, Kennedy MJ, Rogers MT, Porteous ME, Morrison PJ, Platte R, Eeles R, Davidson R, Hodgson S, Ellis S, Godwin AK, Rhiem K, Meindl A, Ditsch N, Arnold N, Plendl H, Niederacher D, Sutter C, Steinemann D, Bogdanova-Markov N, Kast K, Varon-Mateeva R, Wang-Gohrke S, Gehrig A, Markiefka B, Buecher B, Lefol C, Stoppa- Lyonnet D, Rouleau E, Prieur F, Damiola F, Barjhoux L, Faivre L, Longy M, Sévenet N, Sinilnikova OM, Mazoyer S, Bonadona V, Caux-Moncoutier V, Isaacs C, Van MT, Claes K, Piedmonte M, Andrews L, Hays J, Rodriguez GC, Caldes T, de la Hoya M, Khan S, Hogervorst FB, Aalfs CM, de Lange JL, Meijers-Heijboer HE, Van der Hout AH, Wijnen JT, Van Roozendaal KE, Mensenkamp AR, Van den Ouweland AM, Van Deurzen CH, Van der Luijt RB, Olah E, Diez O, Lazaro C, Blanco I, Teule A, Menendez M, Jakubowska A, Lubinski J, Cybulski C, Gronwald J,  Jaworska-Bieniek K, Durda K, Arason A, Maugard C, Soucy P, Montagna M, Agata S, Teixeira MR, Olswold C, Lindor N, Pankratz VS, Hallberg E, Wang X, Szabo CI, Vijai J, Jacobs L, Corines M, Lincoln A, Berger A, Fink-Retter A, Singer CF, Rappaport C, Kaulich DG, Pfeiler G, Tea MK, Phelan CMMai PL, Greene MH, Rennert G, Imyanitov EN, Glendon G, Toland AE, Bojesen A, Pedersen IS, Jensen UB, Caligo MA, Friedman E, Berger R, Laitman Y, Rantala J, Arver B, Loman N, Borg A, Ehrencrona H, Olopade OI, Simard J, Easton DF, Chenevix- Trench G, Offit K, Couch FJ, Antoniou AC, on behalf of CIMBA1. Associations of common breast cancer susceptibility alleles with risk of breast cancer subtypes in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. Breast Cancer Res 2014 ; 16 : 3416 (IF : 5.881, SIGAPS : B).

Orsetti B, Selves J, Bascoul-Mollevi C, Lasorsa L, Gordien K, Bibeau F, Massemin B, Paraf F, Soubeyran I, Hostein I, Dapremont V, Guimbaud R, Cazaux C, Longy M, Theillet C. Impact of chromosomal instability on colorectal cancer progression and outcome. BMC Cancer 2014 ; 14 : 121 (IF : 3.319, SIGAPS : C).

Witkowski L, Carrot-Zhang J, Albrecht S, Fahiminiya S, Hamel N, Tomiak E, Grynspan D, Saloustros E, Nadaf J, Rivera B, Gilpin C, Castellsagué E, Silva-Smith R, Plourde F, Wu M, Saskin A, Arseneault M, Karabakhtsian RG, Reilly EA, Ueland FR, Margiolaki A, Pavlakis K, Castellino SM, Lamovec J, Mackay HJ, Roth LM, Ulbright TM, Bender TA, Georgoulias V, Longy M, Berchuck A, Tischkowitz M, Nagel I, Siebert R, Stewart CJ, Arseneau J, McCluggage WG, Clarke BA, Riazalhosseini Y, Hasselblatt M, Majewski J, Foulkes WD. Germline and somatic SMARCA4 mutations characterize small cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic type. Nat Genet 2014 ; 46 : 438-43 (IF : 29.648, SIGAPS : A).

CONFÉRENCES ACADÉMIQUES SUR INVITATION
NATIONALES
Sévenet N. Modélisation des cancers et approches massives en oncogénétique. Application à la maladie de Cowden. Session délocalisée de l’Académie Nationale de Pharmacie. Bordeaux, 4 avril 2014.

Sévenet N. Quoi de neuf dans la maladie de Cowden ? Soirée du Réseau Femmes à risque. APHP, Paris, 15 octobre 2014.

Sévenet N. Nouveautés dans la maladie de Cowden. Journées de Sénologie de l’Hôpital Saint-Louis. Paris, 19 septembre 2014.

Sévenet N. Diagnostic BRCA rapide, est-ce possible, quelles indications ? Journées Infigyn. Tarbes, 2 octobre 2014.

Sévenet N. Genome evolution during progression to breast cancer. 73e réunion du Groupe d’Etude et de Réflexion sur les Mastopathies. Paris, 15 mai 2014.

Sévenet N. Approches massives de génomique en oncogénétique. Société de Pharmacie de Bordeaux. Bordeaux, 9 juillet 2014.

Sévenet N. Séquençage de nouvelle génération avec un panel de gènes. Journée NGS. Bordeaux, 20 novembre 2014.

Sévenet N. Breast-cancer risk in families with PALB2 mutations. 74e réunion du Groupe d’Etude et de Réflexion sur les Mastopathies. Paris, 15 octobre 2014.

Actualités
  • Louise CRIVELLI a reçu en novembre 2015 le 3ème prix de vulgarisation décerné par l’ARC à l’occasion de leur journée « Jeunes Chercheurs ». Pour découvrir l'article du Sud Ouest, cliquez ici. Pour consulter l'article de la revue Génétique et Cancer, cliquez ici.


Vue complète des projets en cours (PDF) : cliquer ici

Archives

Vue complète des projets en 2013 : cliquer ici

 

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